L'accademia Kamome e' nel caos ora che Tsukasa e i suoi stanno prendendo di mira i Custodi del Tempo! Nene, che e' in grado di distruggere gli yorishiro, e' stata rapita da Tsukasa stesso, che si e' intrufolato nell'area di dominio del primo dei sette misteri scolastici. Ad attenderli, pero', sono proprio i tre Custodi! Ha finalmente inizio il processo dei Custodi del Tempo!